为了有效减少高填方路基的后期沉降，可以从以下几个方面采取措施：

1.选择合适的填料：优先选用强度较高、压缩性较低且具有良好水稳定性的材料作为填料。对于含水量较高的土质，应进行适当的处理后再使用。

2.控制施工质量：严格控制每层填筑厚度和压实度，保证路基填土的密实度达到设计要求。同时，在分层碾压过程中要避免出现过湿或过干的情况，确保压实效果良好。

3.设置排水设施：在高填方路段设置有效的地表及地下排水系统，防止水分积聚导致土体软化和沉降加剧。

4.采用预压法施工：通过提前加载荷重的方式使路基在正式通车前充分固结，从而减少后期的不均匀沉降。

5.加强监测与维护：对高填方路段进行定期检测，及时发现并处理可能存在的隐患。同时，在雨季等特殊天气条件下加强巡查力度，确保排水畅通无阻。

6.采用土工合成材料加固：使用土工格栅、土工布等材料来提高路基的整体稳定性和承载能力，减少沉降量。

通过上述措施的综合应用，可以显著降低高填方路基在后期运营过程中的沉降风险。