在工程项目的清单计价中，确定综合单价是一个关键步骤。综合单价是指完成一个规定计量单位项目所需的人工费、材料费、机械使用费、管理费和利润，并考虑风险因素的费用总和。具体来说，可以按照以下步骤来确定：

1.详细分析工程量清单：首先需要仔细阅读并理解工程量清单中的每一项内容，明确每个项目的施工范围和技术要求。

2.计算直接成本：根据项目特点选择合适的定额或参考市场价格信息，分别计算出完成该分项工程所需的人工、材料和机械台班的费用。这一步是形成综合单价的基础。

3.考虑管理费与利润：在直接成本的基础上加上一定比例的企业管理费及预期利润率，这部分反映了施工企业为完成工程项目所投入的管理和期望获得的收益。

4.风险因素考虑：工程实施过程中可能会遇到一些不确定的风险（如材料价格上涨、政策调整等），因此需要在综合单价中适当预留风险费用。

5.综合计算并核对：将上述各项费用汇总，形成最终的综合单价。同时要确保所有数据准确无误，并符合相关法规和合同约定的要求。

6.调整优化：根据实际情况或招标文件要求，可能需要对初步确定的综合单价进行适当调整以达到最优报价策略。

通过以上步骤，可以较为科学合理地确定工程项目的清单计价中的综合单价。