开发商擅自改变房屋面积的处理办法，可以分为两种：一是按照房产合同的规定处理。二是起诉后由法院按照法律规定作出处理。
如果房产合同对开发商擅自改变房屋面积的违约责任作出了规定，那么开发商就应当按照房产合同的约定承担责任。如果开发商不依据房产合同承担责任，那么则可以向法院起诉。一般来说，法院都会要求当事人按照房产合同的约定承担责任。
如果房产合同未作出相应约定，那么开发商擅自改变房屋面积怎么办？合同未约定房屋面积误差处理办法的，如开发商交付的房屋实测面积与合同约定面积出现误差，根据《商品房销售管理办法》和最高人民法院《关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，面积误差按下列办法处理：
1、面积误差比绝对值在3%以内（含3%）的，据实结算房价款。
2、面积误差比绝对值超出3%时，买受人有权退房。买受人退房的，房地产开发企业应当在买受人提出退房之日起30日内将买受人已付房价款退还给买受人，同时支付已付房价款利息。
买受人不退房的，产权登记面积大于合同约定面积时，面积误差比在3%以内（含3%）部分的房价款由买受人补足。超出3%部分的房价款由房地产开发企业承担，产权归买受人。产权登记面积小于合同约定面积时，面积误差比绝对值在3%以内（含3%）部分的房价款由房地产开发企业返还买受人。绝对值超出3%部分的房价款由房地产开发企业双倍返还买受人。
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